[楊俊逸] 通過免疫沉澱和MinION 定序加速基因體組裝及分析
Tan, C M, et al., 2021 Frontiers in Microbiology
植物菌質體感染會產生植株矮化、花器、簇葉等病徵，可作為研究蘭花型態發育的工具。楊俊逸團隊與中研院郭志鴻研究員合作，針對紫錐菊簇葉病菌質體，開發了一種結合免疫沉澱和MinION測序的方法，來解決植物菌質體全基因組解序的困難。這種方法利用專一性的膜蛋白Imp抗體進行植物菌質體的分離，並且利用MinION測序產生具有高mapping rates和高基因組覆蓋率的long reads。研究成果發表於2021年Frontiers in Microbiology (Tan et al., 2021)。
文章出處：https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.766221/full